Notre Dame de Lourdes a des relations privilégiées avec quelques lycées, dans lesquels la plupart de ses élèves poursuivent leurs études après la 3ème : Lycée Notre Dame de Mongré (Villefranche), Lycée Notre Dame (Villefranche les Marais), Lycée Sandar (Limonest), Lycée Notre Dame de Bel Air (Tarare).
En outre un bon nombre de collégiens continuent dans un lycée public ou dans un des établissements suivants : Lycée Sainte Marie (Lyon 5ème), Lycée Jean Baptiste de la Salle (Lyon 4ème), Lycée les Lazaristes (Lyon 5ème), Lycée Notre Dame des Minimes (Lyon 5ème), Lycée la Favorite (Lyon 5ème), Lycée Saint Marc (Lyon 2ème), Lycée Notre Dame de Bellegarde (Neuville), Lycée Saint Joseph (Tassin).
Le Collège Notre Dame de Lourdes travaille aussi avec d’autres établissements scolaires du Nord-Ouest de Lyon, en particulier le Collège Notre Dame (Claveisolles), le Collège Champagnat (L’Arbresle), l’Ecole Sainte Bernadette (Chasselay), l’Ecole Saint Joseph (Dardilly), l’Ecole Saint François (Anse), l’Ecole Saint Martin (Limonest), l’Ecole Notre Dame (Marcy l’Etoile).